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致病菌(Pathogenic bacteria ) 是能引起疾病的微生物，也被稱為病原微生物，其包括細菌、病毒、螺旋體、立克次氏體、衣原體、支原體、真菌及放線菌等。
病原微生物包括細菌、病毒、螺旋體、立克次氏體、衣原體、支原體、真菌及放線菌等。一般所說的致病菌指的是病原微生物中的細菌。細菌的致病性與其毒力、侵入數量及侵入門戶有關。雖然絕大多數細菌是無害甚至有益的，但是相當大一部分可以致病。條件致病菌只在特定條件下致病，如有傷口可以允許細菌進入血液，或者免疫力降低時。 例如，金黃色葡萄球菌和鏈球菌也是正常菌群，常可以存在于體表皮膚，鼻腔而不引起疾病，但可以潛在引起皮膚感染，肺炎(pneumonia)，腦膜炎(meningitis)敗血癥(sepsis)
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